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认真搞好栽培环境的灭菌、灭虫和处理好培养料的发酵。在培养料第三次翻堆时，用200倍的敌敌药液，边翻料边喷洒，并用塑料薄膜覆盖熏闷，以杀料堆中的虫体和虫卵。出现菇蝇时，可用0.1％的鱼腾精或0.2％的乐果乳剂喷射，或利用其成虫的趋光性，淮北羊肚菌，用黑光灯进行诱杀。螨类属蛛形纲蚂螨目的一种害虫，统称为螨。体形只针头大小，肉眼不易看见，主要由培养料带入。用放大镜观察，体扁平椭圆形，白色或黄白色，成堆时呈淡黄褐色，象灰尘或米糠一样。虫体上有多根刚毛，成虫有四对肢，行动缓慢，多产卵于培养料或菌褶间。此类虫嗅觉灵敏，羊肚菌市场价，播种后，就很快聚集菌种周围，嗜食幼嫩菌丝，使播种后不见菌丝萌发。若在菌丝体生长后侵入，羊肚菌一亩成本，会把菌丝咬断或使幼蕾死亡。彻底消灭螨类很难，要采用早期预防，综合防治的办法。
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